根系分析系統(tǒng)按成像方式不同，可分為對原位根系圖像的分析儀，以及對洗根后的根系圖像分析儀。一般都要求可分析根系的長度、直徑、面積、體積、根尖數(shù)、分叉數(shù)、根交叉數(shù)等。

    再專業(yè)些的根系分析系統(tǒng)，還可分析植物根系的主側(cè)根拓撲形態(tài)關(guān)系、連接關(guān)系，以及根尖部 位的色彩變化，以便進行根系形態(tài)和構(gòu)造研究。最新的根系分析系統(tǒng)應(yīng)具備大批量圖像的全 自動分析特性，用戶可對自動分析結(jié)果進行局部的交互編輯修正，以確保數(shù)據(jù)的科學性。對原位根系圖像，因根系與土壤的顏色可能非常接近，故國內(nèi)外均采用圖像中根系目標的自 動增強后，以交互引導(dǎo)的方式進行標記分析的。另外，還有引入分形維數(shù)，以及直方圖投影來進行根系整體生物量分析的。根系分析的最新技術(shù)還可分析根瘤菌體積在根系中的占比，以客觀確定根瘤菌體的貢獻量。
    托普云農(nóng)研發(fā)的這套根系分析系統(tǒng)是目前市場上應(yīng)用較多的一套設(shè)備。它能進行根系的顏色分析，確定出根系存活數(shù)量，輸出不同顏色根系的直徑、長度、投影面積、表面積、體積。此外，系統(tǒng)還具備人工輔助修正：圖像可放大縮小和局部觀察；根據(jù)尺寸等方面的區(qū)別，進行自動雜質(zhì)剔除。