對于蒙牛“問題奶”事件，蒙牛的解釋是飼料發霉導致乳品黃曲霉毒素M1超標。然而，飼料發霉或許是肇事源頭之一，但“問題奶”的關鍵究竟在于蒙牛內部監測缺失，還是生產環節存在紕漏?
　
　據了解蒙牛眉山生產基地的原奶過半為香港上市公司現代牧業（01117.HK）位于洪雅縣的洪雅牧場（下簡稱現代牧場）所提供，但是現代牧場負責人劉長軍劉長軍說，他們與蒙牛的合作還和之前一樣，生產照常，牛奶照送，蒙牛也沒為問題奶找過他們，在2008年公司剛成立時，蒙牛曾派人駐場。據稱，蒙牛對牧場整個生產流程均有一定標準，且會監管。“從擠奶，到收集至緩沖罐，到進入制冷設備降溫，再到奶倉收儲，全過程都會查看。”此外，蒙牛的駐站員還會查看管路、奶倉等原奶的收集設備和運輸設備的衛生情況，檢測空氣凈度、奶牛乳房潔凈度和管路微生物殘留等。“比如管路微生物殘留，牛奶會有一定量殘留在管道壁上，滋生一定微生物，工作人員會拿測試紙在管道上擦一下，再放到器皿中培育，檢測微生物情況是否達標。”劉解釋稱。

　對于飼料環節是否被監控劉長軍稱具體不知情：“不知從何時起，蒙牛已開始撤離駐場員。”對蒙牛駐場員撤離一事，劉長軍認為，“這是蒙牛對現代牧業規范化養殖的認可與信任”。“我們這種養殖場操作規范，能完全達到蒙牛的標準，甚至超標準。蒙牛會覺得他們的駐場員起不到作用，沒有必要再派人駐場”。

 “問題奶”事件曝光后，蒙牛集團新聞發言人盧建軍對媒體表示，原奶供方和公司有一個誠信合約，公司有一個管理機制在約束，目前已經管控到牛的嘴和獸藥的問題上。
　有消息稱，在三聚氰胺事件后，蒙牛集團已投入30億元進行奶源建設，并表示從奶源到成品嚴格把關，確保“批批檢驗、批批合格”。為此，蒙牛為奶站安裝了攝像頭，為奶牛建立譜系檔案;運奶車都是恒溫儲運，并安裝了GPS以確保24小時可監控。蒙牛集團副總裁姚海濤曾表示，將對更多奶站進行托管，對不具備托管條件的，會派人監管。

　然而事實是，蒙牛在現代牧場的駐站員早已撤離，蒙牛的其他合作牧場是否亦如此，尚未證實。